龍王殿是一箇多義詞，具體含義取決於上下文。以下是兩種不同的解釋：
龍王殿位於御碑亭的北側，是龍王廟行宮的主要建築，也被稱爲綠瓦殿。
龍王殿位於二進後院，坐北朝南，由3眼砌石拱圈窯洞組成。正面有砌石雕花裝飾、石屋檐、石斗拱。臺基下築有3處踏道垂帶3級砌石階。正中一眼爲龍王殿，西側一眼爲窯神殿，東側一眼爲土地殿。龍王是中國神話中四靈之一，龍王殿是神話傳說中在水裏統領水族的王，掌管行雲降雨，爲人消滅炎旱和煩惱。
此外，龍王殿也在禪院西側，與大雄寶殿相鄰，是白鱟仙翁的供奉處，道教活動場所。龍王殿始建於元末，相傳鬥巖曾有白鱟仙翁，能呼風喚雨，興雲作霧曾助明太祖朱元璋大敗勁敵。殿前有東西拱門，上嵌石額。東額鐫“洞開陶壁”，意寓鬥巖山安樂優美。西額鐫“徑壁葛陂”，是以東漢末年，黃巾起義軍與鮑鴻大戰於河南葛陂，仙人費長房投杖化龍的典故，隱寓鬥巖白鱟仙翁霧助朱元璋戰勝張士誠，敕封“龍王”的傳說。殿正中供奉金井龍王。