製作DNA模型的步驟可以根據所使用的材料和複雜度分為幾種不同的方法。以下是一些常見的製作方法：
基礎模型製作。使用彩色卡紙、膠棒、剪刀、信號筆和膠帶等材料。首先，製作四種不同顏色的長方形卡紙代表脫氧核糖，圓形卡紙代表磷酸，長條形卡紙代表化學鍵。將脫氧核糖與鹼基和磷酸連線，製作脫氧核苷酸。連線多個脫氧核苷酸，製作DNA單鏈模型。按照鹼基互補配對原則，製作另一條DNA單鏈，兩條鏈反向平行。用膠帶代表氫鍵，將兩條鏈固定，形成平面模型。最後，用細木棍固定兩端，螺旋狀旋轉形成雙螺旋結構。
高級模型製作。使用硬塑方框、細鐵絲、球形塑膠片和不同顏色的長方形塑膠片等材料。首先，組裝脫氧核苷酸模型，然後製作多核苷酸長鏈模型。兩條長鏈的單核苷酸數目必須相同，且鹼基之間能夠互補配對。接著，製作DNA分子平面結構模型，將兩條多核苷酸長鏈互相連線。最後，旋轉DNA分子平面結構，形成雙螺旋結構。
摺疊紙張模型。將彩色紙摺疊成雙層，繪製DNA序列。剪下不同的DNA鹼基並貼上到相應的位置上。打開摺疊的紙張，形成DNA雙鏈結構。
這些方法提供了不同複雜度和材料選擇的靈活性，適合不同年齡和技能水平的製作者。