《勇者鬥惡龍怪獸篇3》的攻略主要包括以下幾個方面：
捕捉怪物。每個地圖不同季節出現的怪物不同，戰鬥隊伍中每個寵物的攻擊或智力影響捕捉成功率。地圖通關後，名聲上升，捕捉機率提高。如果寵物包和牧場中沒有該寵物，捕捉機率會很高。建議前期不要同時抓兩隻同類寵物，以節省時間。高等級寵物可使用特定肉類進行捕捉，如怪物誘餌、帶骨肉、霜降肉等。使用肉類時，可以讓寵物先防禦，然後攻擊，以提高捕捉效率。
怪物配合。在塔的地下一層，可以使用兩隻怪物進行配合，配合後父母消失，可以繼承一半技能點。選擇親代的技能樹進行合成，可以獲得更高級的技能。
技能學習。每個怪物可以攜帶3個技能樹，通過配合可以繼承技能。遊戲中，屬性攻擊是主要的輸出手段，因此吐息類技能（固定傷害）從小怪用到通關。物理系建議後期使用，以實現暴力輸出。
前期快速練級。遊戲開始時，可以抓到強大的怪物，如深藍色小蝙蝠（多拉其），這是前期最強的怪物。抓兩隻並進行合成，可以使技能升級。這種怪物的經驗需求低，升級快，是初期練級的好選擇。
遊戲進程和地點。打敗加坦達後，回巴哈拉達鎮。與店內人員對話得到黑胡椒，然後去見波特加國王，乘船去旅行。訪問拉希魯村買隱身草，然後前往安吉貝亞城。在安吉貝亞的地下室找到乾渴壺，使用它可以在淺灘處找到小廟，得到魔鑰匙。用鑰匙打開亡靈村的底特恩村牢房門，得到綠水晶。在日本村的山洞深處打敗八頭大蛇得到紅水晶。在塔中跳下找到回音笛。
以上是《勇者鬥惡龍怪獸篇3》的主要攻略和遊戲進程指南。