Ori基因，全稱origin，是DNA序列上固定的複製起始點，主要作用如下：
質粒複製起始位點：Ori是一段DNA序列，作為質粒複製的起始位置。在質粒中，DNA解螺旋酶可以作用於這段序列，使DNA的雙鏈被分開，從而開始複製過程。質粒必須能夠複製，否則隨著細菌的生長，質粒的數量將會被迅速稀釋。Ori控制著質粒的複製，並決定了質粒的宿主屬性和拷貝數。
宿主擴增質粒的能力：Ori對於宿主擴增質粒的能力至關重要。只有能被宿主細胞複製蛋白質識別的質粒才能在該種細胞中複製。
高度保守的序列：Ori是原核生物基因質粒的複製起始位點，由四個高度保守的19bp組成的正向重複序列。這些序列對於質粒的複製至關重要。
影響轉錄效率：在真核生物中，RNA聚合酶II所識別的啟動子區在–70～–80區含有CCAAT序列（CAAT box），這種序列能增強或促進轉錄的起始，因此被稱為增強子或強化子。雖然Ori本身不直接參與轉錄過程，但其存在和狀態對轉錄效率有間接影響。
綜上所述，Ori基因在原核生物中作為質粒複製的起始位點，對質粒的複製、宿主屬性、拷貝數以及轉錄效率有著重要的影響。