Apple Pencil的用法如下：
使用Apple Pencil在任意文本欄中輸入文本。可以在iPad上的任意文本欄中使用Apple Pencil書寫，然後「隨手寫」功能會將手寫文字自動轉換為鍵入的文本，即使手寫文字超出文本欄邊緣也能轉換。若要使用操作快捷鍵，請輕點「隨手寫」工具列，可用操作包括「撤銷」「顯示鍵盤」等。
在「備忘錄」和「無邊記」中輸入文本。在「備忘錄」或「無邊記」中，輕點以顯示工具調板，在工具調板中，輕點手寫工具（筆左側），使用Apple Pencil書寫，然後「隨手寫」將手寫文字轉換為文本。
選擇和修正文本。使用Apple Pencil和「隨手寫」輸入文本時，可以執行多種操作，如刪除字詞、插入文本、連線或分開字元、選擇文本、選擇字詞、選擇段落等。可以通過圈住文本或在文本下面劃線來選中文本。
速繪或快速手寫備忘錄。在iPad上打開「備忘錄」App，使用Apple Pencil塗鴉或書寫。可以使用多種「標記」工具和顏色，並繪製直線。將使用Apple Pencil書寫的手寫內容轉寫為鍵入文本，然後將其貼上到其他備忘錄或App中。
截屏和標記截屏。使用Apple Pencil從iPad左下角輕掃以截屏，然後在出現的縮略圖上使用繪圖工具添加想法或反饋。
更改Apple Pencil設定。例如，設定雙擊切換工具，或調整手寫區域。
充電和配對。Apple Pencil（第2代）可以吸附到iPad上右側的磁性接口進行充電和配對。對於Apple Pencil（第1代），可以插入iPad上的閃電接口進行充電。
此外，Apple Pencil（第2代）可以通過雙擊筆的頂端或底端來快速切換工具或執行特定操作。