PFGE法，全稱脈衝場凝膠電泳(Pulse Field Gel Electrophoresis)，是一種用於分離和分析大型DNA分子的技術。它在分子流行病學、物理圖譜構建、基因組結構分析等領域有著廣泛的套用。PFGE通過使用交變電場，使DNA分子在瓊脂糖凝膠中改變遷移方向，從而實現不同大小的DNA分子的分離。這種技術可以分離的DNA分子量通常在10kb到10Mb之間。
在PFGE過程中，首先使用限制性內切酶切割細菌染色體DNA，產生較大的DNA片段。這些片段在脈衝場凝膠電泳中分離，形成獨特的電泳條帶圖譜。通過比較不同菌株的電泳條帶圖譜，可以研究病原體的遺傳多樣性、菌株之間的變異以及關聯性。
PFGE的優點包括高解析度、良好的重複性和穩定性。它被廣泛用於分子流行病學研究中，幫助追蹤感染來源、監測疫情暴發、分析抗生素耐藥性的傳播模式等。此外，PFGE也是國內外監測程式中的「金標準」，用於研究細菌的分子流行病學特點，能夠從整個基因組的角度考慮菌株間的關係。