均方根偏差
RMSD值是均方根偏差(Root Mean Square Deviation)的縮寫，它是一種統計學上的參數，用於衡量數據點偏離平均值的程度。在分子動力學模擬、蛋白質結構解析、模建、結構聯配等領域，RMSD值被廣泛用於評估原子或分子相對於參考結構的偏離程度。具體來說，RMSD值越大，表明原子或分子的運動空間範圍越大，空間位阻越小。RMSD值的計算通常涉及到一個時間段內原子位置的變動情況。
需要注意的是，RMSD值與HRV（心率變異性）中的RMSSD（相鄰正常心動周期差值的均方根）是兩個不同的概念。RMSSD是心率變異性的一個指標，主要反映機體副交感神經的活動情況，其正常值範圍為(27±12)ms。