RNAseq,即RNA測序,是一種高通量測序技術,廣泛套用於轉錄組水平的研究,可以反映mRNA、small RNA、noncoding RNA等分子的表達水平。RNAseq的主要套用包括:
差異基因表達分析。通過對比不同條件下的基因表達水平,識別差異表達基因(DEG),了解基因表達的變化。
基因結構分析。包括mRNA的可變剪接、非編碼RNA的鑑定和分析等。
富集分析。通過GO(基因本體)和KEGG等工具,分析差異表達基因的生物途徑和功能富集,從而理解這些基因在生物學過程中的作用。
單細胞基因表達分析。空間轉錄組學。結合長讀長技術和直接RNA測序技術,可以更精確地研究特定細胞或組織在特定時間和空間下的基因表達情況。
RNAseq的基本流程包括提取RNA、構建測序文庫、高通量測序,以及後續的數據分析和解讀。這些技術不僅促進了我們對基因表達、轉錄調控等生物學過程的理解,還為疾病診斷、藥物研發等領域提供了新的工具和視角。