五邑通卡的充值可以通過以下幾種方式進行：
使用帶有NFC功能的安卓手機，通過微信進行充值。首先確保你的五邑通卡背面帶有「交通聯合」標誌或「C」標誌（2015年之前發行的卡可能不支持充值），然後打開手機NFC功能（通常在設定中的連線頁面），在微信中開啟NFC功能（在微信設定—通用頁面），將五邑通卡貼在手機的NFC感應區域（通常在手機背面靠近攝像頭的位置，具體位置參見手機說明書），待手機回響後選擇微信套用打開，選擇充值金額進行支付，輸入支付密碼後保持卡片緊貼感應區域，等待程式完成充值。
使用五邑通自助充值終端。這些終端布點在江門五邑通客服中心、江門汽車總站風雨連廊、江門公汽中心站等多個地點。
到7-11連鎖便利店等指定的充值網點進行人工充值。
需要注意的是，蘋果手機不支持此功能。如果在充值過程中遇到網路中斷或卡片沒有緊貼感應區域等問題導致充值失敗，可以在充值頁面的「充值訂單」中申請「補充值」或「退款」。