木馬病毒是指隱藏在正常程序中的一段具有特殊功能的惡意代碼，是具備破壞、刪除文件、發送密碼、記錄鍵盤、攻擊Dos等特殊功能的後門程序，也是計算機黑客用於遠程控制計算機的程序，將控制程序寄生於被控制的計算機系統中，裏應外合，對被感染木馬病毒的計算機實施操作，是計算機中常見的病毒之一。
木馬病毒通常有兩個可執行程序：一箇是控制端（客戶端），另一箇是被控制端（服務端）。植入被種者電腦的是“服務端”部分，而黑客正是利用“客戶端”進入運行了“服務端”的電腦。運行了木馬程序的“服務端”以後，被種者的電腦就會有一箇或幾個端口被打開，黑客就可以利用這些打開的端口進入電腦系統，安全和個人隱私也就全無保障了。
木馬病毒還可以對被控計算機實施監控、資料修改等非法操作，一般的木馬病毒程序主要是尋找計算機後門，伺機竊取被控計算機中的重要文件等。木馬病毒具有很強的隱蔽性，可以根據黑客意圖突然發起攻擊，嚴重危害了現代網絡的安全運行。
此外，木馬病毒這個名字來源於古希臘神話中的特洛伊木馬，該木馬被放置在特洛伊城外，城內的人們將其當作祭神的木馬運入城內，最終導致希臘軍隊裏應外合成功攻陷特洛伊，因此在計算機領域，木馬病毒同樣具有欺騙性，用戶往往無法直接識別其存在，直到被攻擊者竊取信息或者控制計算機。