生物污染是指由生物有機體對人類健康或生態系統造成的不良影響。
生物污染可按物種分為動物污染和微生物污染，其中微生物污染在室內環境中常見，能傳播疾病並引發多種危害，例如通過塵埃、飛沫等傳播的病原微生物，如甲型流感病毒和冠狀病毒。生物污染還涉及水、氣、土壤和食品的污染，影響生物產量和人類健康，例如廢水中的致病微生物、食品中的微生物、寄生蟲和蟲卵，以及昆蟲污染等，這些污染物可能堵塞管道、腐蝕金屬、惡化水質、影響食品質量，甚至可能引起食物中毒和傳染病。此外，生物污染還包括外來生物被無意或有意引入新生態系統，可能對該系統造成破壞或危害。