科學方法論是關於科學研究的一般方法的理論，它探索方法的一般結構，闡述它們的發展趨勢和方向，以及科學研究中各種方法的相互關係問題。科學方法論有廣義和狹義之分：
狹義的科學方法論指的是關於科學研究、科學評價、科學發展的正確的一般方法，例如觀察法、實驗法、數學方法等。
廣義的科學方法論則是由正確的世界觀決定的人們正確的認識世界改造世界的根本方法，它是狹義科學方法論的理論基礎，包括對稱方法、複雜系統論方法、還原論與整體論相統一的方法等多種根本方法。
科學方法論不僅是關於科學的一般研究方法的理論，而且是一門思維科學，它研究如何運用客觀規律自覺地認識世界和改造世界的理論。科學方法從本質上講就是認識世界、改造世界的方法。