借款的入賬流程通常包括以下幾個步驟：
簽訂借款協定：公司間借款應簽訂書面的借款協定，明確借款金額、期限、利率、還款方式、違約責任等條款，以便於後續的核對和記賬。
設定會計科目：公司間借款應設定相應的會計科目進行核算，一般情況下，可以設定「其他應收款」或「其他應付款」科目來記錄公司對外提供或收到的借款，同時設定「財務費用」或「利息收入」科目來記錄借款產生的利息費用或收入。
記賬方法：借款的記賬方法應根據借款的發生、計提、支付、收回等環節，按照借貸記賬法的規則，做好借貸雙方的借貸記賬，以保證借款的完整性和一致性。
計提和支付利息：公司間借款的利息費用或收入，應按照借款協定約定的利率和期限，按月或按季度計提，並在實際支付或收到時進行結算。計提的利息費用或收入，應分別借記「財務費用」或「利息收入」科目，貸記「應付利息」或「應收利息」科目。支付或收到的利息費用或收入，應分別借記「應付利息」或「應收利息」科目，貸記「銀行存款」或「現金」科目。
還款和收回本金：公司間借款的本金，應按照借款協定約定的方式和時間，進行還款或收回。還款或收回的借款本金，應分別借記「其他應付款」或「其他應收款」科目，貸記「銀行存款」或「現金」科目。
繳納稅費：公司間借款的利息收入，應按照稅法規定，繳納營業稅和附加、企業所得稅等相關稅費。
在實際操作中，還需要取得相關的原始憑據，比如公司內部的管理檔案，公司之間簽訂的契約或者是協定，以及對方開具或者是提供的收款收據，作為入賬的依據。