卡路里赤字指的是消耗的能量超過攝入的能量，這種情況對身體有當下和長期的影響。
在短期內，身體可能會進入飢餓狀態，導致甲狀腺調節新陳代謝的激素減少，新陳代謝速率下降。身體為了節省能量，會進入一種較為緩慢的運作狀態，這會影響身體恢復受損細胞的能力。此外，長期卡路里赤字還可能影響身體對某些微量元素（如鐵、鈣、維生素D、B12、葉酸等）的攝取，導致貧血、易疲勞，甚至影響骨骼硬度，增加骨折風險。
長期來看，卡路里赤字可能導致在運動較短時間內就感到疲勞，這種感覺類似於長跑中的「撞牆」現象。這是由於身體缺乏足夠的能量，導致疲勞感加劇。