原子的大小取決於如何定義原子半徑，這並非一個確切的物理量。一般來說，原子的直徑在0.1納米（10⁻¹⁰m）左右。然而，也有觀點認為原子的大小一般在3×10⁻¹¹米（0.03納米）至3×10⁻¹⁰米（0.3納米）之間。
此外，原子內部的結構也非常微小。例如，電子的半徑大小，傳統觀點認為是2.8×10⁻¹⁵m，而現代觀點則認為是10⁻²²m。質子的半徑大小約為10⁻¹⁶m，而原子核的半徑數量級在10⁻¹⁴～10⁻¹⁵m之間。
需要注意的是，由於原子和其子粒子的大小極小，因此這些尺寸都是基於科學實驗的推斷和理論計算的結果，實際上很難直接測量。