反式作用元件（trans-acting element）是真核生物基因表達調控中的重要組成部分，與順式作用元件（cis-acting element）相對。反式作用元件本身不編碼任何蛋白質，而是通過與其他蛋白質的相互作用來調控基因表達。這些元件可以存在於不同的染色體或DNA分子上，因此被稱為「反式」。
反式作用元件與順式作用元件相互作用，後者是存在於DNA分子上的一些與基因轉錄調控有關的特殊順序。順式作用元件包括啟動子、增強子、調控序列和可誘導元件等，它們提供一個作用位點，需要與反式作用因子相互作用才能發揮其功能。
反式作用元件包括各種蛋白質因子，這些因子可以直接結合或間接作用於DNA、RNA等核酸分子，對基因表達發揮不同的調節作用，如激活或抑制。反式作用因子通常包含兩個重要的功能結構域：DNA結合結構域和轉錄活化結構域，這些都是其發揮轉錄調控功能的必需結構。反式作用因子可以是被誘導合成的，其活性也受到多種因素的調節。
總之，反式作用元件通過與順式作用元件的相互作用，在真核生物的基因表達調控中發揮著關鍵作用。