修剪咖啡樹的方法主要包括以下幾點：
單幹修枝。適用於小粒種及大粒種咖啡。剪除過多的次生分枝，集中養分，增加結果量。例如，當咖啡樹從二分枝變爲多骨幹枝時，可以修除纖細下垂、結果力弱的枝條。
多幹修枝。適用於中粒種咖啡。保留3~4條粗大的直生枝（基部吸芽），培育新幹。待新幹生長粗大後，砍掉原主幹頂部。
打頂控高。爲了便於採摘，當咖啡樹株高達到1.5~1.8米時，可摘除頂芽控制株高。
修除直生枝。剪去主幹上的直生枝，以避免消耗植株營養，影響通風透氣性，並減少病蟲害。
控制分枝。剪去正常結果枝上多餘的次生枝，確保產量和品質。對於衰退的結果枝，剪去靠近主幹的二級或三級分枝。
剪去枯枝。及時剪去因養分不足、產量過高、極端天氣或病蟲害造成的枯枝。
截幹更新。對於多年結果的咖啡樹，可以將主幹從距地面20~30釐米處截幹更新，待抽生新枝後，保留1~2條爲主幹。
通風透光修剪。剪除離地面30~35釐米以下的一級枝條和離樹幹12釐米以內的二級枝條，保證空氣流動。控制一級枝條層數，使各層間隔大於15釐米。
重剪法。對於生長健壯且已多次結果的一級枝，剪除樹幹45釐米以外的所有枝條，每條一級枝上保留3~5條二級分枝。
啄木鳥式修剪法。對於無生產能力或受災的枝條，剪除離樹幹15釐米以外的一級分枝，每條一級枝上只保留4條二級枝。
這些方法可根據咖啡樹的種類、生長環境和健康狀況進行調整。適時修剪有助於提高咖啡樹的產量和品質。