員工股權激勵機制涉及的部門主要包括：
1. 人力資源部門：負責推動公司股權激勵計畫的制定、實施和維護。
2. 法務部門：負責審核股權激勵計畫的法律檔案，確保合規性。
3. 財務部門：負責股權激勵計畫的財務核算和資金安排。
4. 董事會：負責決定公司股權激勵計畫的具體政策和方案，並對實施情況進行監督。
5. 投資部門：負責分析股權激勵計畫對公司價值的影響，為公司提供投資建議。
6. 股東大會：作為公司最高權力機構，負責審議和批准股權激勵計畫等重大決策。
此外，一些公司可能還會涉及其他部門，如證券事務部門、合規部門等，具體視公司組織結構和規模而定。