如果在日本不慎丟失了護照，可以按照以下步驟進行補辦：
儘快到附近的警察局報案，並開具遺失證明。
攜帶遺失證明和其他必要文件，如在留卡、學校的在學證明等，前往中國駐日本領事館申請掛失和補發新護照。
需要準備的照片要求清晰、神態自然，爲白底彩照，尺寸爲30毫米x40毫米，並在照片後面用鉛筆寫上本人姓名和出生年月日。
填寫《中華人民共和國護照申請表》，並詳細寫明丟失經過。
通過“中國領事”APP提交申請，包括上傳照片、填寫個人信息、支付2000日元等步驟。
等待初審和複審，並通過後郵寄所需材料。
需要注意的是，在辦理過程中，舊護照即使找到也不能再使用，新護照和剪掉一角的舊護照將會通過郵寄方式寄回。