地坑院的排水方法主要包括以下幾個方面：
設定集水坑。在地坑院的角落挖掘一個土井，這個井被稱為滲坑，用於收集雨水。土井的深度一般為5到6米，較大的可達十幾米。井口直徑較小，而井底直徑較大，形成葫蘆形狀。在井底鋪設一層爐渣等材料作為過濾層，以便雨水經過小型過濾層後，可以用於洗衣、餵牲口等。
修建高牆面。在地坑院的頂部周圍修建約1到2米的矮牆，使頂部牆面比周圍地面高，這樣可以有效避免雨水倒灌，並利用地坑院頂部的斜坡將雨水引導至特定區域。
使用排水溝和集水井。在基坑內開挖排水溝，並在溝底設定集水井，使雨水流向集水井，然後用水泵抽出。這種方法適用於較深的坑，可以分層設定排水溝和集水井。
利用現代化設施。在現代地坑院的設計中，可能包括小型化糞池或排污泵，將污水抽到室外的污水系統中。
這些方法共同構成了地坑院有效的排水系統，不僅適應了當地的氣候條件，而且體現了古代中國人民的智慧和創造力。