大薏仁和小薏仁主要在以下幾個方面有所區別：
營養價值。小薏仁仁的營養價值通常被認爲比大薏仁高。小薏仁含有豐富的氨基酸、鐵、磷、鈣、維生素B族以及生物鹼等營養成分。而大薏仁雖然也含有氨基酸、維生素和微量元素，但數量通常不如小薏仁多。
外觀大小。小薏仁一般比大薏仁小，通常與綠豆大小相似，而大薏仁則與黃豆相當。
顏色。小薏仁脫殼後的顏色通常是青白色，而大薏仁則是黃白色。
功效和用途。小薏仁主要功效包括健脾開胃、促進食物消化和吸收，以及通氣回乳等，而大薏仁則主要用作五穀雜糧，具有輔助減肥效果和補充營養的作用。
藥用價值。小薏仁具有藥用價值，可用於養生保健，而大薏仁主要作爲食品食用。
產地。在某些地區，大薏仁主要產於甘肅東南部，而小薏仁則主要產於江西南部。