天主教和基督教之間存在幾個主要區別：
教義和神學觀點不同。天主教認為耶穌是上帝的兒子，強調聖父、聖子和聖靈的三位一體觀念，並重視聖事（如洗禮、聖體、聖餐等）和教會組織的層級性，認為教宗是上帝在地上的代表，有權教導信仰。而基督教則更強調個人與上帝直接的關係，認為耶穌是上帝的使者，主要聖事為洗禮和聖餐，不強調教宗的至高無上性。
教會組織和結構不同。天主教擁有嚴格的教會等級制度和教階體系，強調聖職人員的權威和中介作用，教會以羅馬為中心，有統一的教會組織。而基督教的教會組織更加民主和多樣化，信徒參與度更高，沒有統一的中心，主要的新教派別包括加爾文宗、路德宗等。
聖經的看法不同。天主教承認《新約聖經》中的「聖傳」，並特別尊崇聖母瑪利亞，認為耶穌之母是「天主之母」，而基督教則沒有特別的聖母崇拜，更強調個人因信稱義的教義。
對聖事的理解不同。天主教認為聖事對於信徒的成聖和恩寵的賦予具有重大意義，是神人溝通的不可或缺的渠道，而基督教認為聖事主要是象徵性的，強調個人與上帝的直接關係。
對教會與神職人員的看法不同。天主教認為人必須通過教會並由神職人員才可以與神溝通，教會和神職具有神聖性，而新教則認為人可以憑藉信仰與神溝通，不必通過教會和神職人員。
這些差異反映了兩種宗教在信仰、組織形式、神學觀點等方面的根本性不同。