天然宿主是指那些能夠長期攜帶某種病原體而不表現出症狀的宿主。它們為病原體提供了營養和保護，使病原體能夠在其中完成其生命周期。天然宿主可以是動物，也可以是昆蟲。例如，鹿鼠是幾種人畜共患病病原體的天然宿主，包括伯氏疏螺旋體、鹿蜱病毒(DTV)和引起漢坦病毒肺症候群(HPS)的新型漢坦病毒(SNV)。
除了鹿鼠，蝙蝠也被認為是多種病毒的天然宿主，包括伊波拉病毒、SARS病毒、MERS病毒等。蝙蝠的獨特免疫系統和廣泛的分布使其成為了眾多病毒的理想宿主。這些病毒在蝙蝠中可能以潛伏的形式存在，而在某些情況下，它們可以通過中間宿主傳播給人類，造成疫情爆發。