天然食用色素是從自然來源中提取的色素，與人工合成色素相比，它們不僅可以為食物增添色彩，還可能具有營養價值和健康益處。常見的天然食用色素及其來源如下：
紅色素。來源於草莓、火龍果、紅菜、紅曲米等，其中紅曲米是由紅麴黴菌發酵而成的，常用於食品著色。
橙色素。來源於焦糖色、胡蘿蔔、胭脂樹橙等，其中胭脂樹橙是從Bixa Orellana樹種子外層提取的，含有Bixin和Norbixin等色素。
黃色素。來源於玉米、鳳梨、檸檬、梔子花果實等，梔子花果實含有大量的天然黃色素，常用於魯菜和其他中式烹飪中。
綠色素。來源於菠菜、抹茶粉等，其中抹茶粉是由嫩綠茶葉片製作而成的精細粉末，具有獨特的香氣和顏色。
此外，天然食用色素還包括藍色素如花青素，紫色或紅色素如甜菜根中的甜菜紅素、黑米、黑麥中的黑色素、藍莓和黑莓中的花青素等。這些色素不僅為食物增添美觀的外觀，還可能具有抗氧化、抗炎和其他健康益處。