進行Meta分析的基本步驟如下：
選題。這是決定Meta分析成功與否的關鍵步驟，選題應基於研究領域內存在爭議的問題，或單個研究結果差異較大的主題，選題應具有創新性、爭議性和可實施性，遵循PICOS原則（Participant[研究對象]，Intervention[干預措施]，Comparison[對照組]，Outcome[研究結果]，Study design[研究設計/研究方法]）來確定主題。
確定納入和排除標準，制定檢索策略。納入標準通常包括研究類型、研究對象、結局指標等，不滿足這些條件的文獻需要排除，同時，還需制定文獻檢索策略，使用布爾邏輯運算符連接主題詞和自由詞進行檢索。
文獻數據的篩選與選擇。利用文獻管理軟件（如NoteExpress或EndNote）對檢索結果進行篩選，注意不同數據庫的檢索步驟和操作可能有所不同。
文獻質量評價。在進行研究結果合併前，需要對納入的文獻進行質量評價，評估單個研究在設計、實施、結果分析過程中可能出現的偏倚，常用的質量評價工具有Cochrane風險偏倚評估工具、Delphi清單、Jadad量表、CONSORT聲明等。
數據整理和分析。按規範格式整理數據，進行異質性分析（通過異質性檢驗/森林圖等方式），如果存在異質性，使用隨機效應模型，深入探索異質性問題的原因，並通過亞組分析、Meta迴歸等方式分析發表偏倚（通過漏斗圖、Begg檢驗和Egger檢驗等方式分析），最後分析Meta模型的穩健性，通過敏感性檢驗和森林圖可視化結果。
得出科學結論。確保異質性分析及探索、發表偏倚問題的處理，並確保模型具有穩健性。