清洗比色皿時，應遵循以下步驟：
初步清洗。倒掉比色皿中的液體，用清水沖洗乾淨殘留物。
浸泡清洗。如果殘留物難以清除，可以使用中性洗滌劑或洗碗液在溫水中浸泡比色皿，也可使用稀釋的酸性或鹼性清潔劑，但需按照說明操作。
刷洗。使用軟毛刷或海綿輕輕擦洗比色皿的內外壁，注意力度要輕，避免劃傷比色皿表面。
沖洗。用去離子水充分沖洗比色皿，去除殘留的清洗液和污漬，確保比色皿內部也被沖洗乾淨。
乾燥。用乾淨的紙巾或潔淨的布輕輕擦乾比色皿，避免使用毛巾或紗布，以免留下纖維殘留。
此外，在清洗過程中，要注意保護比色皿的結構和透光性能，儘量採用中和溶解的方法來達到清潔的效果。對於特定類型的污漬，如有機物質殘留，可以使用相應的有機溶劑（如酒精）進行清洗。清洗完成後，檢查比色皿是否乾淨，無殘留洗滌劑或化學物質。