使用嫩肉粉時，應注意以下幾點：
用量。嫩肉粉的用量一般為原料重量的0.5%至1%。
溶解。應先將嫩肉粉溶於適量的清水中，然後再將肉塊、肉片或肉絲放入溶液中拌和均勻。
溫度。嫩肉粉中的木瓜蛋白酶活性與溫度有關，最佳溫度約為60℃。高溫或低溫都會影響酶的活性。
時間。嫩肉粉對原料產生作用需要一定的時間，一般在常溫下靜置15至30分鐘為宜。如果時間過長，可能導致原料失去彈性；如果時間過短，嫩化效果不佳。
pH值。嫩肉粉發揮最佳效果的最佳pH值在7至7.5範圍內。過酸或過鹼的環境都可能影響嫩肉粉的效果。
急用情況。如果需要急於烹飪，可以將溶有嫩肉粉的溶液與肉類原料混合後放在大約60℃的環境下，以加快嫩化過程。在這種情況下，大約放置5至8分鐘就可以用來烹飪。
特殊情況。將嫩肉粉溶入姜蔥水中再碼制，效果更佳。
請注意，過分使用嫩肉粉可能不利於肉品成型，因為過多的分解作用會使肉質變得鬆散。