封隔器的工作原理主要基於其設計和內部結構，具體包括液力擴張式和壓縮式封隔器。液力擴張式封隔器在達到設計深度後，通過油管內加壓，高壓液體通過封隔器內部的傳壓孔隙作用於膠筒內腔。在節流壓差的作用下，膠筒膨脹並封隔油套環空。當油壓釋放，油套壓力平衡後，膠筒靠自身的回彈力收縮回原狀實現解封。壓縮式封隔器的工作原理類似，通過加壓使活塞機構作用，壓縮膠筒膨脹封隔油套環空，解封過程同樣依賴於膠筒的回彈力。
此外，還有特定型號如Y221和Y341封隔器，它們的工作原理涉及坐封和解封過程，包括使用扶正器、彈簧、滑動銷釘等部件來確保膠筒的密封效果。例如，Y221封隔器通過上提、右旋、下放管柱的過程來實現坐封，而Y341封隔器則通過液壓作用來實現坐封和解封。
手動和自動保險槽的設計也是封隔器原理的一部分，它們影響封隔器的操作方式和密封效果。例如，自動保險槽的設計允許封隔器在特定條件下自動完成坐封和解封過程。
綜上所述，封隔器的工作原理涉及複雜的機械和液壓系統，包括但不限於膠筒的膨脹與收縮、內部傳壓孔隙的作用、以及特定型號封隔器的坐封和解封機制。