工程成本核算方法主要包括以下幾種：
會計記賬憑證核算法。以會計記賬憑證為依據，對項目中的各項業務及其各個環節使用各種憑證進行具體核算和管理。
表格核算法。基於內部項成本核算形成項目成本核算體系的一種方式。
業務核算法。對項目中的各項業務的各個程式環節用各種憑證進行具體核算管理的一種方法。
審核費用。首先需要對發生的費用進行審核，以確定哪些應計入工程成本及各項期間費用的數額。
費用分配和歸集。將應計入工程成本的各項費用在各個成本對象之間進行分配和歸集，以計算各工程成本。
盤點未完工程。對未完工程進行盤點，以確定本期已完工程成本的實際成本。
結轉已完成工程成本。將已完工程成本轉入「工程結算成本」科目中。
施工企業的成本核算。以單個項目為核算對象，分別核算工程施工成本。未完工前，按單個項目歸集實際成本。資產負債表日，根據完工百分比法確認契約收入的同時，確認工程施工毛利。對於未完工工程項目的工程施工成本，累計確認的工程施工毛利與對應的工程結算對抵後的餘額列示於存貨項目。