巴氏消毒法，也稱為巴氏滅菌法，是一種熱處理方法，用於殺滅或去除食品中的有害微生物。這種方法得名於其發明人，法國生物學家路易斯·巴斯德。巴氏消毒的原理是利用病原體不耐熱的特點，通過適當的溫度和保溫時間處理，將細菌全部殺滅。然而，經過巴氏消毒的食品仍可能保留小部分無害或有益、較耐熱的細菌或細菌芽孢。因此，巴氏消毒後的食品需要在低溫下保存，並且有一定的保存期限。
目前國際上通用的巴氏高溫消毒法主要有兩種：
將食物加熱到62℃-65℃，保持30分鐘。這種方法可以殺死食物中的各種生長型致病菌，而殘留的通常是部分嗜熱菌及耐熱性菌以及芽孢等，其中多數是乳酸菌，這些乳酸菌對人無害反而有益健康。
將食物加熱到75℃-90℃，保溫15-16秒。這種方法殺菌時間更短，工作效率更高。但殺菌的基本原則是將病原菌殺死即可，溫度太高反而可能導致營養損失。
巴氏消毒法最初是為了解決啤酒釀出後變酸的問題而開發的。巴斯德發現，以50~60攝氏度的溫度加熱啤酒半小時可以殺死啤酒里的乳酸桿菌和芽孢，而不必煮沸。這一方法挽救了法國的釀酒業，並使得巴氏消毒法得以廣泛套用。
在牛奶處理過程中，巴氏消毒法也得到了廣泛套用。巴氏消毒牛奶需要在4℃左右的溫度下保存，且只能保存3~10天，最多16天。當今使用的巴氏殺菌程式種類繁多，包括「低溫長時間」(LTLT)處理、「高溫短時間」(HTST)處理和「快速巴氏殺菌」等。其中，「高溫短時間」(HTST)處理是一個「流動」過程，通常在板式熱交換器中進行，被廣泛套用於飲用牛奶的生產。