年楚河發源於喜馬拉雅山脈北麓，具體源頭位於日喀則地區康馬縣境內，海拔5200米。它自南向北流經康馬、江孜、白朗、日喀則四縣市，在日喀則市東北郊匯入雅魯藏布江，匯合處海拔3860米。年楚河的全長為217千米，流域面積近41130平方公里。