庭院植物配置應遵循幾個主要原則：
選擇植物時，應避免有毒、造型怪異或容易引起過敏的植物，如康乃馨和夜來香。建議選擇多年生宿根或球根植物，如桂花、臘梅、薰衣草和鼠尾草等芳香類植物。
根據四季景觀變化選擇花色鮮艷、花期長且低維護的植物，如圓錐繡球和龜背竹等本土植物，適應特定地區的氣候條件。
考慮庭院的陰暗程度，選擇耐陰植物。
植物選擇應與庭院風格相配，利用植物的形狀、色彩、質感營造個性化空間效果。
中式庭院強調自然、和諧、含蓄和意境，常用植物包括桂花、垂絲海棠、石榴、臘梅等。日式庭院設計通常遵循不對稱原則，風格寧靜、簡樸。
此外，植物配置不僅需遵循科學性，還要講究藝術性，在配置時考慮植物間的關係、園林其他要素間的配置，如山石、水體、建築和園路等。