關於徐福的去向，存在多種說法和傳說，但主流的觀點認為徐福可能去了日本。根據《史記》的記載，徐福「得平原廣澤，止王不來」，意味著他找到了一處有水源的平原，並在那裡稱王不再回來。而從中國的沿海向東航行，符合這一描述的地方只有日本列島和朝鮮半島。日本方面的證據包括在日本九州半島佐賀縣有徐福的土地紀念碑和徐福的石沖祠堂，以及日本學者Aoye Lixiong先生的證實，表明徐福在日本的主要活動區域可能是九州雄野附近。
此外，日本文獻中也有關於徐福的記載，並將其尊之為司農耕和醫藥之神，這進一步支持了徐福可能去了日本的說法。儘管如此，關於徐福的確切去向，由於缺乏確鑿的史料，至今仍然是一個未解之謎。