微生物在我們的飲食中扮演著重要角色，它們參與了許多食品的製作過程。
微生物通過分解不同的物質來獲取能量，這些物質包括糖類、有機酸、蛋白質、二氧化碳等，其中，糖類、有機酸、蛋白質和二氧化碳是微生物最常利用的碳源，而蛋白質及其降解產物、銨鹽、硝酸鹽、分子氮、脲、胺、醯胺等則是微生物利用的主要氮源，此外，微生物還需要維生素、胺基酸、嘌呤和嘧啶等營養物質來維持生長，一些無機鹽，如磷酸鹽、硫酸鹽以及含有鈉、鉀、鈣、鎂、鐵等元素的化合物，也是微生物生長所需的，水對於微生物來說至關重要，它不僅是微生物生長的溶劑和運輸介質，還參與細胞內的各種化學反應，在自然界中，森林土壤碳庫是陸地生態系統中最重要的碳庫之一，其中的微生物通過分解枯枝落葉和死亡的根系等有機物來滿足自身的生長和繁殖需求，微生物在食品製作中的套用非常廣泛，如製作優酪乳、乾酪、酒釀、泡菜、醬油、食醋、豆豉、乳腐、黃酒、啤酒、葡萄酒等，這些食品不僅具有獨特的風味，還為人類的飲食生活帶來了豐富的選擇。