自製酵素的過程主要包括以下幾個步驟：
準備材料。可以將果皮（如柚子皮或乾橘皮）、蔬菜（如雞蛋殼）、糖（如紅糖或黑糖）和EM菌加入到發酵容器中，這些材料可以幫助加速發酵過程，並有助於消除臭味。
剪碎材料。將加入的材料剪碎或切成小塊，這樣不僅便於放入瓶子，還可以加速發酵過程。
放入容器。將準備好的材料放入發酵容器中，注意不要裝得太滿，需要留出一定的空間供發酵過程中排氣使用。瓶蓋不要擰太緊，以避免在發酵過程中因氣體無法排出而導致瓶子爆炸。
配比。酵素水肥的配比可以按照1:3:7的比例進行，即一份材料、三份糖、七份水。也可以按照1:3:10的比例進行，即一份糖、三份果皮、十份水。
發酵時間。夏季氣溫高時，發酵時間通常為兩三周；冬季氣溫低時，發酵時間可能需要一兩個月。
使用。發酵好的酵素可以用來澆花或果樹，具有很好的肥效。
需要注意的是，在製作過程中要確保環境的清潔和安全，避免接觸皮膚和眼睛。