手動擋汽車熄火的原因可能有操作不當、油路故障、電路故障、設備故障等。具體包括：
操作不當。如油離配合不順暢、離合和油門控制不當、剎車時未踩離合器、起步時離合器抬起過快等。
油路故障。如燃油系統故障、油路不暢、噴油器和燃油濾清器異常等。
電路故障。如低壓斷電、電路故障等。
設備故障。如火花塞失效、點火線圈問題、電子點火模組故障等。
駕駛技術不夠熟練。如擋位和速度不匹配、操作不熟練等。
發動機或車載電腦短路斷電。
怠速控制系統工作不正常。
油泵油壓太低。
此外，手動擋汽車熄火的原因還有進氣系統、點火系統、燃油系統出現故障，節氣門堵塞或損壞等。在緊急情況下，如緊急剎車或半坡起步時，特別容易出現熄火，可以通過改善油離配合、控制好離合和油門的操作、提高駕駛技術等措施來減少熄火情況的發生。