日本的行政區劃主要分為一級行政區和二級行政區兩個層次。
一級行政區包括「一都、一道、二府、四十三縣」。具體來說，一是「東京都」（Tokyo），是日本的首都；一是「北海道」（Hokkaido），是日本四個主要島嶼中最北的一個，也是日本最大的島嶼；二是「大阪府」（Osaka）和「京都府」（Kyoto），這兩個府是日本歷史上重要的城市；四十三縣（省）分布於日本的四個大島和八大地區中。
二級行政區根據人口數量細分為「市（shi）、町（chou）、村（son）」等。這些行政區域在行政上地位平等，它們都不從屬於一級行政區域，但地位不同，根據人口數量而定，市最多，村最少。此外，由於北海道面積較大，為了提高行政效率，特意在「市、町、村」之上又單獨設定了振興局。東京都下面設有23個「特別區」，這些「特別區」與「市、町、村」同為二級行政區。