東南亞的地形主要分爲兩大類：
中南半島的地形以高原和山地爲主，山脈與河流相間，縱列分佈，地勢呈現北部高、南部低的特點。主要的地形區包括撣邦高原、川壙高原等。河流下游通常有三角洲，地勢較爲平坦。
馬來羣島的地形則以山地爲主，多火山和地震，這是因爲該地區位於板塊交界處。重要的地形區包括伊洛瓦底江平原、湄南河平原、湄公河三角洲、紅河三角洲等。主要河流包括伊洛瓦底江、薩爾溫江、湄公河、紅河等，而重要湖泊有洞裏薩湖、多巴湖。
此外，東南亞的氣候類型多樣，中南半島主要爲熱帶季風氣候，而馬來羣島則爲熱帶雨林氣候。