模型漆的毒性主要取決於其類型和成分。模型漆分為水性漆和油性漆，其中油性漆又分為琺瑯系和硝基系。就毒性而言，劣質的油漆，不管是哪種類型，毒性都很大。按照國家標準，毒性的大小順序為：硝基系 > 琺瑯類 > 水性漆。
模型製作使用的塗料、膠粘劑、清洗劑均含有不同比例的揮發性有機物(VOCs)，這些物質對人體健康有害。VOCs是生成近地面臭氧的重要前體物，是國家重點控制的大氣污染因子之一。油性塗料中普遍含有的苯、甲苯等VOCs物質具有一定毒性，長期接觸對人體健康有害。
在使用模型漆時，應採取適當的防護措施，包括選擇明確標註防護有機蒸汽的防毒面具，避免皮膚直接暴露在空氣中，以及保證作業場所負壓，向外排風。如果條件不允許，不建議進行噴漆作業。