樣品基質是指在分析樣品中，除了分析物以外的所有其他物質和組分，包括溶劑等。基質效應是指樣品基質中的一種或多種成分對目標分析物檢測結果的影響，可能會導致目標分析物響應增強或減弱。在實際檢驗工作中，樣本都是被加工過的，檢測後依舊有一定的差異，這個差異反映了樣本處理過程中的基質效應。校準品和質控品的產生後，引起了對基質效應的深刻思考，爲了保證校準品與質控品的使用，會對其做一些相關處理，無論是加入物質（分析物、防腐劑、穩定劑）、還是冷凍/乾粉化處理、還是加水復溶的過程等等，都會使得最後的分析物與患者真實血清不同，會引起一些真實血清不會出現但處理過後的血清會出現的明顯偏移，這也使得溯源性方面上得到一箇不定的未知因素（溯源到物質不是患者真實血清）。