製作檸檬酵素的方法有多種，以下是一種常見的做法：
準備材料。檸檬、黃冰糖或白砂糖、無酒精白醋、乾淨的玻璃密封罐。
檸檬處理。用鹽搓洗檸檬以去除表面的蠟質和雜質，然後用清水沖洗乾淨，檸檬切片，厚度適中，去除檸檬籽以避免苦味，確保使用的刀具和砧板無水無油。
罐子準備。將玻璃密封罐用開水清洗乾淨，確保無水無油，晾乾。
碼放檸檬和糖。在罐子底部鋪一層糖，加入一層檸檬片，再鋪一層糖，重複這個過程直到罐子約八分滿，留下空間供發酵。
加入白醋。倒入足夠的無酒精白醋以覆蓋檸檬片，確保白醋完全沒過檸檬。
密封發酵。蓋上蓋子，放置在陰涼通風的地方，開始發酵。
日常維護。在發酵過程中，每天打開蓋子放氣並攪拌一次，以促進糖的溶解和氧氣的流通。
飲用方式。發酵完成後，將檸檬酵素稀釋後飲用，通常建議以1份酵素配4~6份水的比例稀釋。
請注意，在整個製作過程中保持器皿的乾淨和無水是非常重要的，以避免酵素變質。