《殭屍校園》的結局是主角團在逃亡過程中,遇到了重重困難,但最終成功逃脫學校。在逃亡的過程中,青山不幸被咬,變成了喪屍,班長南拉為了保護其他人,選擇了離開主角團,繼續守護朋友們。多年後,溫召仍在尋找班長的蹤跡,偶然間在學校的樓頂發現了班長,班長已經克服了病毒,進化成了新人類,但拒絕跟著朋友走出去,帶著自己的使命,從樓頂一躍而下。
在逃亡的過程中,溫召的爸爸老南從外面打開了大門,主角團們有驚無險的逃出了球館。他們穿過工地,越過山就可以到達洋東市,開始了新的生活。在逃亡的過程中,宇進為了保護姊姊而被咬,南拉為了不讓已經變成喪屍的宇進攻擊大家,只好用力將他的頭扭斷。最後,倖存下來的學生們重建家園,開始了新的生活。