水培植物肥料可以選擇自製肥料或商業肥料。自製肥料包括使用過濾後的養魚水或發酵好的淘米水，這些水中含有豐富的微量元素和氮磷等營養元素，有助於水培植物的根系發展和葉片生長。商業肥料方面，可以選擇專門針對水培植物設計的植物營養液，如百花泉或活力水精靈，這些肥料富含氮磷鉀等大量元素和微量元素，能促進植物生長，同時添加了抑菌成分如納米銀，有效防止綠藻、線蟲生長，保持水質清潔。
使用肥料時，應注意稀釋比例，避免過度施肥，並定期使用pH平衡水沖洗水培系統，以防止養分積累和鹽分積累。同時，根據植物的生長階段調整養分溶液，保持適宜的pH值，並確保養分溶液均勻分布到所有植物中。