水宜生水杯的使用方法如下：
第一次使用時，需要對微電解保健杯進行清洗。打開微電解保健杯蓋，將開水倒入微電解保健杯內，上下震動和晃動杯體，然後倒掉並重複此過程幾次，直到倒出的水變得清澈。
日常使用時，可以根據個人喜好選擇冷水或熱水。冷水使用純淨水、礦泉水、冷開水或淨化過的水，倒入微電解保健杯中約三分鐘，飲用前上下震動即可。熱水則是將純淨水、礦泉水或自來水燒開後倒入微電解保健杯中，自然冷卻至大約50度，然後即可飲用。
泡茶時，將開水倒入微電解保健杯中，等待10分鐘後即可泡茶。或者將泡好的茶葉水倒入杯中，5至10分鐘後飲用。也可以直接將茶葉放入杯中，但需確保沒有茶葉末。
水宜生水杯中的功能杯芯可以處理1.5至2.0噸的水，使用壽命大約在3至4年。到期後，需要更換功能杯芯。
定期可以使用pH試劑檢查微電解保健杯的功效，若pH值大於8.0，則表明功效正常。或者使用一滴食用油測試，如果油滴在杯中的水面上分散，也表示功效正常。
一個月左右，建議使用檸檬酸或白醋清洗水杯一次。使用白醋清洗的方法是，倒入約五分之一的白醋在杯體內，搖動30秒後倒出，重複幾次，直到白色顆粒不明顯為止。