水治理的方法主要包括以下幾種：
減少廢水和污染物排放。包括節約生產廢水、改善生產工藝和管理制度、提高廢水的重複利用率、採用無污染或少污染的新工藝。
生物治理。使用生物方法如活性污泥法、生物膜法、生物接觸氧化法等處理水污染。
物理治理。包括膜工程法、吸附法（如使用活性炭吸附有機物和重金屬）。
化學治理。利用化學反應改變污染物性質，如化學沉澱法、中和法。
清淤疏浚。定期清除水體中的淤泥、雜草、垃圾等。
水質淨化。採用生物、物理、化學方法處理污水。
水生態修復。增加水生植被、引進適宜水生生物，如魚類、藻類等，以增強水體自淨能力。
加強監管。建立水體監測、管理、評估體系。
節水制度的建立和實施。包括工業用水最佳化、生水技術使用、提高水的綜合利用率等。
這些方法可以單獨或結合使用，以達到有效治理水污染和保護水資源的目的。