水泛丸起模是製作水泛丸的一個重要步驟，主要是將藥粉製成直徑0.5～1mm大小丸粒的過程。具體步驟如下：
準備藥粉。一般使用過五至六號篩的藥粉，對於起模用粉或蓋麵包衣用粉，建議使用過六至七號篩的藥粉。起模用粉應選擇具有適宜粘性的藥粉，粘性過強或無粘性的藥粉都不利於起模。
濕潤匾面。先用刷子沾少量清水刷於匾內1/5處，使匾面濕潤。
撒布藥粉。將藥粉均勻撒在濕潤的匾面上。也可以使用篩子將藥粉篩到濕潤區。
輕揉藥匾。輕揉藥匾使藥粉均勻貼在藥匾上。
掃下藥粉。使用刷子由一端順序掃下藥粉置藥匾另一端。
重複步驟。重複刷水、掃粉、撒粉的步驟，直到形成細小的藥模。
加大藥模。形成的細小藥模較濕潤後，加入少量藥粉，使藥粉與細小藥模相互黏合，細小藥模逐漸加大。
完成起模。重複以上步驟，直到可見細小丸粒，然後逐漸增加加水加粉的量，直至丸模直徑約1mm時，起模完成。
此外，還有使用濕粉制粒起模法，即將起模用的藥粉製成顆粒，再經旋轉摩擦，撞去稜角成為丸模。起模過程中需要注意用水和用粉量的控制，以及操作的熟練度。