沙漠鬼火的原因可以從兩個不同的角度來解釋：
自然現象角度：
人體內部含有磷、硫、鐵等元素，其中骨骼里含有較多的磷酸鈣。
當人體死後，在地下腐爛過程中，會發生化學反應，使磷由磷酸根狀態轉化為磷化氫。
磷化氫是一種燃點很低的物質，常溫下與空氣接觸便會燃燒。
磷化氫沿著地下的裂痕或孔洞冒出到空氣中燃燒，發出藍色的光，這就是磷火，也被稱為「鬼火」。
遊戲設定角度：
在某些遊戲中，如《我的世界》，沙漠鬼火實際上是由蜘蛛的眼睛造成的。
當玩家不小心把隱身藥水撒在沙漠上時，生物（包括蜘蛛）中了隱身藥水會呈現透明狀態，而蜘蛛的眼睛卻沒有辦法被隱身，所以就形成了沙漠鬼火的奇觀。
這兩種解釋分別從科學和遊戲設定的角度提供了對「沙漠鬼火」原因的不同理解。