河豚毒素主要分佈在河豚的幾個特定部位，包括：
生殖腺：河豚的生殖腺主要是指卵巢和精巢。卵巢含有劇毒，是河豚體內含毒量最大的部分之一。精巢則含毒量較小或無毒。
肝臟：河豚的肝臟是一箇較大的器官，位於腹腔右側，上部接胃部，下部尖端達肛門附近，呈灰褐色，內側具有一綠色的膽囊。肝臟也是含有毒素的重要部位。
血液：特別是脾臟，即所謂的積血塊，含有劇毒。腸胃、胃和腸也有毒，但毒性相對較小。
其他部位：雖然河豚的其他部位如眼睛、皮膚和肌肉也可能含有毒素，但這些部位的毒素含量相對較低。值得注意的是，如果河豚死亡後一段時間，內臟的毒素可能會滲入肌肉，增加食用風險。
綜上所述，河豚毒素主要集中在其生殖腺、肝臟、血液以及部分腸胃中。在處理和烹飪河豚時，應特別注意去除這些含毒部位，以確保食用安全。