《洛克人EXE》是一款結合了RPG和ACT元素的遊戲，玩家在遊戲中控制主角熱斗，通過PLUG IN操作電子世界，解決各種謎題和戰鬥。遊戲的基本玩法包括：
戰鬥系統。遊戲中的戰鬥場地分為兩塊，左邊是玩家行動區域，右邊是敵人行動區域。玩家需要選擇晶片來攻擊敵人，並在時間進度條充滿時進入下一個回合。
迷宮探索。玩家需要通過踩雷來遇敵進入戰鬥，同時也要調查門和藍色水晶數據來推進故事。在迷宮中，玩家可以獲得各種晶片和特殊道具。
角色發展。遊戲中的角色可以通過裝備不同的晶片來增強能力，例如，裝備ロングソードS晶片可以組合出攻擊力400的劍PA。
故事驅動。遊戲的故事通過完成各種任務和解決謎題來推進，每個關卡都有其獨特的目標和挑戰。
具體到遊戲的不同章節，例如：
第一話：小火災。玩家一開始需要離開家並上學，然後發現廚房發生火災。玩家需要在電子爐前PLUG IN，使用冰塊消除火柱，最終擊敗真兇FIREMAN，停止火災。
第二話：學校被操縱。玩家需要幫助熱斗調查全校停電的問題，通過PLUG IN班房中的電子黑板來解決問題。
遊戲中的迷宮和戰鬥都需要玩家的智慧和策略，同時也充滿了驚喜和挑戰。