《流星花園》在內地播出不久後被停播，主要原因包括劇中內容對社會尤其是青少年產生負面影響。
這些負面影響主要體現在以下幾個方面：
劇中渲染了早戀、暴力、金錢享受等消極內容，特別是對青少年的價值觀和世界觀產生不良影響。
劇中某些角色通過家庭背景而非個人努力獲得成功，宣揚了金錢至上和拜金主義，這對人生觀尚未成熟的青少年來說，是不良的示範。
劇中還有一些情節以暴力手段解決問題，而非通過法律途徑，這可能會誤導青少年對解決衝突的方法的理解。
此外，由於《流星花園》的受歡迎程度，當時多家電視台安排了播出計劃，但國家廣電總局的停播要求導致這些電視台不得不臨時更換播出劇集，造成了不小的損失。